ものすごく簡単に整理すると、審査庁が「処分庁ないしは処分庁の上級行政庁ではない」場合には「裁決で、当該行為が違法または不当である旨宣言し、処分庁に対し全部若しくは一部の【撤廃】を命じる」ことが出来るのであり、【変更】を命じることはできないということだと思います。
こんにちは。tonchanさんからすでに回答がありますがちょっとだけ。
前提として、審査庁がどこ（誰）になるか、で話が変わります。ざっと
・処分庁自身が審査庁になる （本人）
・処分庁の上級行政庁が審査庁になる （上司）
・処分庁や上級行政庁以外が審査庁 （第三者機関）
など、それによって見方が変わります。処分庁自身が審査、となれば、「自分のやったことを、自分で審査（裁判みたいなこと）をする、というのがヘンな感じですが、お役所の仕組み的に「自分より上の役場が無い（独立してるとか、最高に偉いとか）」ということもあり得ると考えるしかないです。
そう考えれば、審査（裁判というか判断見直しというか）も、
・処分庁が審査庁なら、変更も撤廃（取消）でもなんでもアリ（本人自ら反省したなら、ガラッと変えても、いっそ止めてもいいよね、ということ）
・審査庁が上級行政庁（上司）なら、変更も撤廃も命じられる（上司だから、どう変更しろ、とかわかってるし、やめろと言ってもいい）
・上級行政庁以外なら、撤廃だけ命じられる（第三者だから、これはダメだからやめろ、とは言えるが、専門じゃないから変更内容までは決めきれないだろうということ）
こんな感じに、イメージを持てると理解は深まります。
ただ、行政法はそもそもイメージが持ちにくい（公務員じゃないと内情とか手続きなんてわからん）ものですから、１つ１つイメージを持って理解しようとすると、逆にドツボにハマって時間が無くなります。割り切って、丸暗記しちゃうのも手だと思いますよ。
お二人ともご丁寧な解説をありがとうございました。
命じる、という言葉にひっかかかって誤読しておりました！よく理解できました。
これからもよろしくお願いいたします。